各乗船者は所持するクルーズカードもしくはリストバンドを使い、船内のアセンブリーステーションにてチェックインを行います。避難用点呼・監視プロトコルシステム(Muster Evacuation Monitoring Protocol System)が乗船者の乗船、下船状況を管理します。このプロトコルには非常時にお手伝いが必要な乗船者の情報も含まれます。
長年全船で実施されてきた強靭な衛生・安全対策をもとに、新たにCovid-19に対応する包括的オペレーション手順が作成されました。新たな手順には、全乗船者・全クルー対象の乗船前COVID -19検査や各目的地での管理・保護された寄港などが含まれます。
MSCクルーズの安全基準はIMO、国際安全管理コード(ISM)が定める規制を大きく超え、全クルーが安全に対して責任を持つよう企業文化を育ててます。